Pitanje:
Koja je razlika između VCF specifikacija verzije 4.1 i 4.2?
blmoore
2017-06-01 16:15:56 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Koje su ključne razlike između VCF verzija 4.1 i 4.2? Čini se da v4.3 sadrži dnevnik promjena (specifikacije su dostupne ovdje), ali ranije specifikacije ne sadrže.

Ovaj post biostara ukazuje na jednu razliku: uvođenje Number = R za polja s jednom vrijednošću po alelu, uključujući REF - može li netko nabrojati drugi promjene između ove dvije verzije?

Jedan odgovor:
#1
+16
Iakov Davydov
2017-06-01 16:40:34 UTC
view on stackexchange narkive permalink

To je lako provjeriti, možete preuzeti obje specifikacije u .tex formatu i napraviti diff.

Promjene na v4.2 u odnosu na v4.1:

  1. Format informacijskog polja: dodavanje izvora i verzije kao preporučena polja.
  2. Polje INFO može imati jednu vrijednost za svaki mogući alel (kod R ).
  3. Za sve informacije o ## INFO, ## FORMAT, ## FILTER i ## ALT, dodatna polja mogu se uključiti nakon zadanih polja.
  4. Alternativna baza (ALT) može uključivati ​​ * : nedostaje zbog brisanja uzvodno.
  5. Ocjene kvalitete, uklonjena rečenica: Visoke ocjene QUAL označavaju pozive s visokim povjerenjem. Iako se tradicionalno ljudi koriste cjelobrojne ocjene u fredu, ovo polje smije biti plutajuća točka kako bi se omogućila veća razlučivost za pozive s niskim povjerenjem ako je to potrebno.
  6. Primjeri su se malo promijenili.
  7. ol>
Čini se sirovo razlikovanje prema datotekama sa specifikacijama prilično glupo, u idealnom slučaju postoje negdje dokumentirane razlike, ali hvala što ste ovo saželi!
Također bi vrijedilo generirati usporedbu s 4.3


Ova pitanja su automatski prevedena s engleskog jezika.Izvorni sadržaj dostupan je na stackexchange-u, što zahvaljujemo na cc by-sa 3.0 licenci pod kojom se distribuira.
Loading...